——恭賀生科院馮雁團(tuán)隊(duì)開發(fā) “A-Star" 低豐度SNV核酸富集和檢測(cè)新技術(shù),實(shí)現(xiàn)萬分之一基因突變體的檢出。
2021年4月27日，上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院、微生物代謝國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室馮雁團(tuán)隊(duì)在Nucleic Acids Research（當(dāng)前影響因子：11.501）在線發(fā)表學(xué)術(shù)論文“Argonaute integrated single-tube PCR system enables supersensitive detection of rare mutations"。
上海交通大學(xué)副研究員劉倩和博士生郭翔為該論文共同第一作者，馮雁教授為通訊作者。研究工作由上海交通大學(xué)、上海交通大學(xué)附屬第一醫(yī)院、仁濟(jì)醫(yī)院、人和未來生物科技公司等合作完成。上海交通大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心提供研究平臺(tái)支持。
文章簡介
針對(duì)血液或體液中腫瘤細(xì)胞釋放DNA片段的液體活檢技術(shù)，憑借其無創(chuàng)性、敏感性、動(dòng)態(tài)性等特質(zhì)，可實(shí)現(xiàn)腫瘤早期篩查及伴隨診斷。然而，由于游離核酸含量低和易降解，因此在復(fù)雜背景基因中來特異性富集和檢測(cè)腫瘤基因得到廣泛關(guān)注。常用的PCR等方法具有簡單、省時(shí)等優(yōu)點(diǎn)，但其檢測(cè)靈敏度有限；近年來，基因編輯工具酶CRISPR/Cas在核酸檢測(cè)中的應(yīng)用，提升了檢測(cè)靈敏度和便捷性，但Cas酶對(duì)靶標(biāo)序列PAM選擇性、長鏈guide RNA合成昂貴且不穩(wěn)定等問題，導(dǎo)致檢測(cè)成本、靈敏度、多重性等方面仍存在局限性。因此，研發(fā)能特異性富集靶標(biāo)序列的新型核酸酶是解決上述難題的有效途徑，建立高靈敏度、多重和簡便的新型核酸檢測(cè)技術(shù)對(duì)于基礎(chǔ)研究和臨床應(yīng)用都具有重要意義。
該工作揭示了不同高溫微生物 Argonaute蛋白的核酸酶特性，發(fā)現(xiàn)其對(duì)單堿基突變（SNV）靶標(biāo)序列精準(zhǔn)識(shí)別的規(guī)律，發(fā)展了“一管式"PCR多重核酸富集和檢測(cè)的A-Star（Ago-Directed Specific Target Enrichment and Detection）新策略，實(shí)現(xiàn)血液等樣本中低豐度突變基因的高效、多重富集和檢測(cè)。
相關(guān)產(chǎn)品
在該研究過程中，科研人員使用了李記生物自主研發(fā)的熱門產(chǎn)品：
Pikogreen dsDNA定量試劑盒(超敏)
貨號(hào):AN54L038
——以上圖片截自期
相關(guān)產(chǎn)品介紹
更綠色的無毒核酸染料GelGreen
更新時(shí)間：2021-08-18
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